Лаборатория "Алгоритмы сборки геномных последовательностей" создана на кафедре "Компьютерные технологии" Санкт-Петербургского национального исследовательского университета информационных технологий, механики и оптики в январе 2010 года. Задачей лаборатории является разработка алгоритмов и программного обеспечения для сборки геномных последовательностей, превосходящего мировой уровень по хотя бы одному из параметров: качество сборки, производительность, аппаратные ресурсы. Эта работа осуществляется совместно с центром "Биоинженерия" Российской академии наук.
В настоящее время лаборатория работает над двумя версиями сборщика генома: параллельной (для суперкомпьютера) и распределенной (для кластера). Эти работы выполняются по двум государственным контрактам: №16.740.11.0495 (заключен в рамках Федеральной целевой программы "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России на 2009-2013 годы") и №07.514.11.4010 (заключен в рамках Федеральной целевой программы "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы").
Инициатор создания лаборатории - профессор А. А. Шалыто, руководитель лаборатории - чемпион мира по программированию 2008 года Ф. Н. Царев, консультант - канд. биол. наук Е. Б. Прохорчук (центр "Биоинженерия" РАН).
Создание лаборатории утверждено решением Ученого Совета НИУ ИТМО от 27 декабря 2011 года.